Web-сайт MolBiol.ru
 

English   Deutsche Fassung  Український варіант
[Войти] [Регистрация]
Софт
всего сообщений: 30   страницы (2): < 1 2

раздел новостей: Софт Описание Vector NTI по русски
07.09.2001 03:36  Redactor           к началу страницы  комментарии: 42
Игорь Хмельков (IKhmelkov@IBS.RU) прислал два текста описывающие программу Vector NTI: "Приложения в составе Vector NTI Suite" и "Работа с Gel Display Window (Симулятор гель-электрофореза)". Информация подготовлена по материалам сайта InforMax, help-файлам и с учетом практической работы с программой.
Большое спасибо автору и приятного чтения пользователям.



раздел новостей: Софт Blast в Имб
06.06.2001 02:44  Anonymous / Redactor           к началу страницы  комментарии: 18
Открылся для тестирования новый вычислительный ресурс Bio Informatics Tools.
Программа "Context BLAST search" позволяет проводить поиск по банку нуклеотидных последовательностей NCBI: полнотекстовый по описаниям и BLASTовое выравнивание по последовательностям. Реализован быстрый поиск олигонуклеотидов. Возможен повторный поиск внутри предыдущей выборки.
Разработчики будут благодарны сообщениям о найденных ошибках, ждем писем по адресу bioinf@genome.eimb.relarn.ru.

Константин Трушкин
trushkin@genome.eimb.relarn.ru


раздел новостей: Софт Мол. биол. расчёты
28.05.2001 01:48  Redactor           к началу страницы  комментарии: 17
Сергей Губанов из компании "Bioline" прислал ссылочку на страницу "Laboratory Calculators" компании LabVelocity. Она очень похожа на наш раздел "Расчёты". Мне особенно понравились "Centrifugation Calculator" - за то, что сделан добротно; "Molar Mass Calculator" - иногда действительно полезная штука; "Periodic Table of the Elements" - тоже красиво.
Кстати, есть по крайней мере ещё один web-калькулятор: BioMath на сайте компании Promega.


раздел новостей: Софт Частоты встречаемости кодонов
05.05.2001 01:39  Redactor           к началу страницы  комментарии: 17
Одна из проблем при экспрессии белков связана с редкими кодонами в кодирующей последовательности. На сайте появилась интерактивная форма, позволяющая проанализировать частоты встречаемости кодонов в конкретной последовательности, и таблица частоты встречаемости кодонов в распространённых лабораторных организмах.
Правда, тут же оказалось, что подобный анализ могут делать и некоторые коммерческие программы, но ведь не выбрасывать же из-за этого уже готовую работу.


раздел новостей: Софт TotalLab 1.10
04.03.2001 12:39  Anonymous / Redactor           к началу страницы  комментарии: 659
Я уже как-то писал по поводу программ для обработки изображений. Буду рад, если вас заинтересует нижеизложенное.
Компания Phoretix выпустила программу TotalLab 1.10. Программа предназначена для обработки результатов одномерных форезов, различных array на планшетах и в лунках, а также колоний на чашках. Исходным является изображение в несжатом tif формате. Также можно ввести изображение со сканера, для этого в программе есть свой блок.
В общем, программа оставляет приятное впечатление, хотя немного и непревычна, нет традиционных Windows-функций: drag'n'drop и контекстного меню под правую кнопку. Понять и освоить программу не читая руководство достаточно просто, "интуитивность" интерфейса проступает примерно через час работы (есть подробное руководство 561Кб).
Как получить программу?
Из полезных свойств хотелось бы еще отметить наличие банка маркеров для анализа одномерных форезов (который можно пополнить самому), т.е. вам не придется каждый раз калибровать маркер. Для array можно использовать встроенные и создавать свои разметочные решетки. Удаление фона и обсчет характеристик полосы тоже очень хороши. Результаты выводятся в табличку, которую можно сохранить в виде txt файла или переслать в MS Exсel. Картинку также можно сохранить в bmp формате.
В общем, может и ничего особого, но, исходя из того что программа бесплатна (60 дней, а дальше по совести) и лучше уже описанного мною ранее Gel Imager/Analyzer (Литех) или известного ImageQuant, ее можно смело рекомендовать для внедрения в массы.
Надеюсь, что эта информация будет полезна. Также хочу выразить Вам искреннюю благодарность за Ваш сайт, от меня и моих коллег. Удачи Вам!

С уважением.
Александр Мишарин,
am1@mail.ru
И-т Экспериментальной Эндокринологии ЭНЦ РАМН

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): Ира Алисова, borikun


раздел новостей: Софт По поводу BioMail
24.01.2001 05:54  Redactor           к началу страницы  комментарии: 32
Мы заметили, что с 14 января весь поиск на PubMed ничего не возвращает. То есть в базу данных с 14 января ничего не поступало. Мы поговорили с людьми оттуда, они сказали, что это временная проблема, которую должны починить в пятницу. В результате этого все пользователи биомэйла остануться без статей примерно за пол-месяца.

Дмитрий Мозжерин (dim@pharm.sunysb.edu)


раздел новостей: Софт RasMol - Molecular Visualisation
15.01.2001 05:42  Redactor           к началу страницы  комментарии: 27
Здравствуйте,Я - Козленко Александр Григорьевич, преподаватель биологии в Рубежанском лицее (г.Рубежное Луганской обл., Украина).
Преподавая в профильных классах с углубленным изучением биологии и химии, очень заинтересовался некоторыми вопросами молекулярной биологии, в т.ч. современными методами представления молекул. И, когда начался Всероссийский конкурс "Дистанционный учитель года - 2000", я подготовил и провел урок по своему ресурсу, основанному на работе с программой РасМол (Molecular Graphics Visualisation Tool).
Возможно, кого-то заинтересует этот ресурс в плане работы со студентами - он находится на http://www.kozlenkoa.narod.ru/ или сразу http://www.kozlenkoa.narod.ru/protein.htm. Кроме того, возможно, у кого-то есть подобный опыт использования программ типа РасМола в преподавании - был бы интересно обменяться мнениями.

С уважением и налучшими пожеланиями в наступившем году,

Козленко А.Г.
kozlenkoa@mail.ru


раздел новостей: Софт Итоги обзора о ПК биолога
21.11.2000 05:10  Redactor           к началу страницы  комментарии: 31
Пару недель назад (05.11.00) появился обзор "Программы, которые хорошо бы иметь молекулярному биологу на персональном компьютере". Итоги на наш взгляд более чем замечательные. Во-первых, не остался без последствий плач по поводу дороговизны молекулярно-биологических программ... Во-вторых, на форум пришли ответы по поводу "reference manager" программ и дополнение к обзору:
Большое спасибо Andrey, savromat, VEG, Денису Ларкину, Константину Муранову, Александру Принцу, Кириллу Кашкину и Илье Серебрийскому!!!
Ещё одно важное событие по этому поводу: обзор превратился в коллективный. И в соответствии с этим теперь и оформлен (имеется в виду авторство). Видимо (если не будет других предложений), такое оформление станет стандартом для "коллективных материалов".


раздел новостей: Софт Персональный компьютер биолога
05.11.2000 05:02  Redactor           к началу страницы  комментарии: 33
Всякого человека тянет за предел собственной компетенции. Если раньше мы размещали на сайте то, в чём более или менее разбирались сами, то теперь попробовали написать обзор "Программы, которые хорошо бы иметь молекулярному биологу на персональном компьютере". Не без умысла, конечно. Хочется надеятся, что найдутся умные и добрые люди, которые помогут и просветят.


раздел новостей: Софт BioMail. Следит за Medline вместо вас
25.10.2000 03:54  Redactor           к началу страницы  комментарии: 31
Мы выделили это сообщение цветом, так как информация очень важная. На сайте запущена программа BioMail - для биологов, медиков и всех тех, кто следит за биологическими статьями по биологической или медицинской тематике. Программа абсолютна бесплатна (и останется бесплатной всегда).
BioMail периодически (от двух раз в неделю до раза в месяц по выбору) проводит поиск по заданным вами ключевым словам в PubMed - крупней публичной базе данных биомедицинских журналов и присылает по электронной почте все свежие ссылки. Письма приходят либо в html-, либо в текстовом формате. В первом случае доступны прямые ссылки на статьи, можно экспортировать ссылки в различные форматы и в личную базу данных, хранящуюся на сайте "molbiol.ru" и доступную вам с любого компьютера.
Подробнее о программе смотри в описании, которое подготовил разработчик BioMail Дмитрий Мозжерин (dim@pharm.sunysb.edu), к.б.н., Нью-Йоркский Университет в Стони Бруке.

страницы (2): < 1 2
 
Колонка новостей, спонсор — "Диаэм"
компания 'Диаэм' — cпонсор колонки новостей
поиск по каталогу Диаэм
 

  






Каталоги


Объявления





···
···

molbiol.ru для



···
 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  · Doctor Plastic: увеличение груди - в центре Москвы  · 
···






···
 ·  отличный выбор ванны чугунные с доставкой  ·  подмосковн­­ое уполномоче­­нное туристичес­­кое агентство Coral Travel · 
···

 
 
molbiol.ru  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама

molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов     Rambler