Четырнадцатая международная зимняя молодежная научная школа. Москва, 11-15 февраля 2002 г.
"ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ"
УЧЕБНО-НАУЧНЫЙ ЦЕНТР Института биоорганической химии им. М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН приглашает студентов, аспирантов и молодых ученых (в возрасте до 30 лет) принять участие в работе XIV международной зимней молодежной научной школы.
В программе школы выступления ведущих российских и зарубежных ученых с докладами по приоритетным направлениям физико-химической биологии и биотехнологии. В рамках школы будет проведена конференция молодых ученых, студентов и аспирантов, которые представят 15-минутные доклады или стендовые сообщения. В форме докладов будут представлены работы, отобранные научным жюри из числа заявленных сообщений. Тезисы докладов и стендовых сообщений будут опубликованы.
Заявку на участие в школе и тезисы научного сообщения, оформленные в соответствии с приложениями 1 и 2, просим направить не позднее 15 ноября 2001 г. по факсу: (095)336-43-33 с пометкой "Оргкомитет XIV международной зимней молодежной научной школы". В заявке следует указать, к какой проблеме относится представленное научное сообщение в соответствии с прилагаемой классификацией (приложение 3).
Для публикации сборника тезисов Оргкомитет просит представить электронный вариант тезисов на дискете в Учебно-научный центр Института биоорганической химии им. М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН по адресу: г. Москва ул.Миклухо-Маклая 16/10 (корпус 32, комн. 606).
Справки по телефону: (095)336-46-00, (095)335-62-22 Приложения 1,2,3 можно забрать здесь: запакованный Sch_2002.rtf файл.
Объединение молодых ученых и специалистов (ОМУС) ОИЯИ объявляет о проведении с 4 по 9 февраля 2002 года в г. Дубна Шестой научной конференции молодых ученых и специалистов. Для выступлений с докладами (до 15 мин.) в ходе конференции приглашаются студенты и аспиранты высших учебных заведений, молодые ученые и специалисты ОИЯИ и других научных центров и вузов в возрасте до 33 лет включительно.
Научные секции Более полную информацию можно посмотреть на сайте http://ayss.jinr.ru.
С наилучшими пожеланиями, Наталья Молоканова omus@cv.jinr.ru (Ученый секретарь Совета ОМУС)
Игорь Хмельков (IKhmelkov@IBS.RU) выложил, по-видимому, последнюю часть описания программы Vector NTI: "Расширенный дизайн молекул". Честь и хвала автору! Версию для печати в формате MS Word можно забрать с сайта самого Игоря "WETWARE", посвящённого всему, что находится на стыке био- и информационных технологий (биокомпьютеры, биопроцессоры, биочипы).
"Операции с нуклеотидной последовательностью" - умеет проводить простейшие манипуляции (чтение в обратную сторону, чтение комплементарной последовательности, перевод в двухцепочечную), понимает стандартные обозначения полиморфных нуклеотидов. Можно проводить как одиночное преобразование, так и несколько преобразований одновременно.
"Трансляция нуклеотидной последовательности" - проводит трансляцию нуклеотидной последовательности в выбранных рамках считывания, понимает стандартные обозначения полиморфных нуклеотидов. Можно выбирать несколько рамок одновременно. Можно переключаться между трёхбуквенным и однобуквенным кодом.
Кстати, раз уж зашла об этом речь. Все имеющиеся на сайте программы (кроме BioMail) написаны на JavaScript и исполняются на стороне клиента. Для неискушённых в тонкостях пользователей: это означает, что если сохранить страницу с программой (формой) на локальном компьютере, то программой можно будет пользоваться, не выходя в интернет. Для тех, у кого связь ненадёжная, это может быть полезно.
Компания InforMax Inc. выпустила новую (седьмую) версию Vector NTI Suite. По сравнению с предыдущей версией расширены возможности модуля ПЦР, появились новые опции, усовершенствован алгоритм расчета праймеров. Расширена функциональность инструмента ContigExpress позволяющего собирать последовательности из большого числа коротких сиквенсовых фрагментов. Улучшен пользовательский интерфейс программы для работы с сервером BLAST (BLAST Viewer), появилась возможность пакетной обработки данных. Расширены возможности инструмента для выравнивания последовательностей ALIGNX. Некоторые улучшения внесены и в саму программу Vector NTI.
Новая версия выложена для загрузки. Это полнофункциональный продукт с демонстрационной лицензией. Внимание! Ни в коем случае не следует устанавливать программу поверх предыдущей версии, особенно если она была зарегистрированной. Во-первых базы данных совместимы лишь частично, во-вторых лицензия на предыдущую версию будет испорчена. Более подробно об этом написано здесь.
В Новосибирске с 14 по 20 июля 2002 года пройдёт Третья Международная Конференция по Биоинформатике Регуляции и Структуры Генома (BGRS'2002). Эта конференция продолжит традицию проведения международных конференций серии BGRS.
Дополнение к новости от "30.06.01". По рукам уже гуляет локальная версия Molecular Cloning: A Laboratory Manual Authors: Joseph Sambrook and David W. Russell. Все внутренние ссылки работают. Материал тот же, что и на сайте. Другое дело, что материал сайта гораздо короче, чем материал книги: одни протоколы, практически никаких комментариев. Единственный недостаток локальной версии - не работает система поиска.
24-26 октября 2001 г. в Томском государственном университете будет проводиться Вторая международная конференция на тему «Проблема вида и видообразования».
Предполагается рассмотреть актуальные вопросы макро- и микроэволюционной проблематики. Конференция будет проводиться по типу школы-семинара для молодых ученых с заказными лекциями ведущих ученых-эволюционистов России.
По адресу http://www.molecularcloning.com/ открылась web-версия Molecular Cloning: A Laboratory Manual Authors: Joseph Sambrook and David W. Russell (Третье издание "Маниатиса", вышедшее в декабре прошлого года). Счастливые обладатели трёхтомника могут теперь получить ещё и электронные версии протоколов. Для регистрации нужен шестизначный код, напечатанный внутри лицевой страницы первого тома.
Я совсем не хакер, но не отказал себе в удовольствии чуть поиграть с регистрацией: (i) на один код можно вписать более одного mail адреса; (ii) со второй попытки код, похожий, но не идентичный моему, открыл ещё один доступ.
Это ссылка на сайт лаборатории Физики белка Института белка РАН. Сайт содержит лекции А.В. Финкельштейна по физике белка, ссылку на местное зеркало PDB, местное зеркало сайта структурной классификации белков, программы - предсказатели вторичной структуры белков, а так же огромное количество ссылок на различные базы данных и прочие полезные ресурсы.
Программа "Context BLAST search" позволяет проводить поиск по банку нуклеотидных последовательностей NCBI: полнотекстовый по описаниям и BLASTовое выравнивание по последовательностям. Реализован быстрый поиск олигонуклеотидов. Возможен повторный поиск внутри предыдущей выборки.
Разработчики будут благодарны сообщениям о найденных ошибках, ждем писем по адресу bioinf@genome.eimb.relarn.ru.
Несколько слов о студии звукозаписи "Сибирский тракт". Во-первых, я заказал там четыре альбома Эльмиры Галеевой и наслушаться не могу (песни на стихи А. Ахматовой, О. Мандельштама, П. Веpлена, А. Блока, Г. Поженяна, А. Галича...). Кстати, заказать очень просто, а дело того стоит, так как mp3-запись всё же заметно уступает кассете по звучанию. Во-вторых, очень приятное свойство студии: прежде чем что-то покупать, можно забрать и послушать хорошо сделанную mp3-версию (как раз на их сайт ссылки и сделаны). А если собрать все впечатления в кучу: похоже, что ребята очень хорошие и хочется чтобы всё у них было хорошо.
Сергей Губанов из компании "Bioline" прислал ссылочку на страницу "Laboratory Calculators" компании LabVelocity. Она очень похожа на наш раздел "Расчёты". Мне особенно понравились "Centrifugation Calculator" - за то, что сделан добротно; "Molar Mass Calculator" - иногда действительно полезная штука; "Periodic Table of the Elements" - тоже красиво.
Кстати, есть по крайней мере ещё один web-калькулятор: BioMath на сайте компании Promega.
Глава с прописями растворов реорганизована в отдельный раздел. Поводом послужило значительное расширение списка рецептов растворов солей и плотностей растворов. Кроме того, по статистике посещений это один из самых популярных материалов сайта. Теперь он стал ближе.
Очередные мероприятия образовательной программы "Онкоиммунология - третье тысячелетие"!
Программа функционирует с осени 2000 года в форме так называемых "миникурсов", концепция которых уже знакома слушателям специальной образовательной программы по биохимии, иммунологии, молекулярной и клеточной биологии НИИ ФХБ им. А.Н.Белозерского. Смысл заключается в приглашении зарубежных ученых для чтения лекций в течение всего одной недели, но зато каждый день. Программа "Онкоиммунология - третье тысячелетие" использует такой же подход, но, во первых, является более специализированной, а во-вторых, большинство запланированных в программе лекторов будут читать по-английски, без перевода. Как правило, на неделю приглашается двое лекторов, которые читают каждый день по одной лекции каждый. Лекции начинаются в 15:00 в лабораторном корпусе "Б" (МГУ) и продолжаются примерно до 18:00.
Следующий спаренный миникурс пройдет 21-24 мая 2001 г. Гостями Программы будут Philip D.Greenberg (University of Washington, Seattle, WA, USA) с курсом лекций "Therapeutic immune responses to tumors and HIV" и Robert Schreiber (Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA) - "Cytokines and Immune Responses During Tumor Development").
Кроме того, открыт дополнительный набор в группу углубленной подготовки (Advanced Training Group) Программы. Эта группа объединяет молодых научных работников (в основном аспирантов), собственные исследования которых так или иначе соприкасаются с раковой иммунологией. С этой группой лектора проводят дополнительные занятия по углубленному изучению лекционного материала.