Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Выделение геномной ДНК из растений -- comments to a permanent page of the site --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Тема связана с: Выделение ДНК из растений
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Forum robot
Постоянный участник
на сервере в Москве



 прочитанное сообщение 13.07.2005 17:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Выделение геномной ДНК из растений. Выход: в зависимости от типа ткани: 0.3 - 200ng DNA на 1mg ткани. Из листьев арабидопсиса получалось 80ng/mg. Наибольший выход из эмбрионов и листьев, наименьший - из органов хранения крахмала. Получается ДНК размером 40 - 70kbp. Годится для рестрикции и PCR.
Участник оффлайн! error
Постоянный участник
192.168.0.1



 прочитанное сообщение 13.07.2005 17:56     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Можно выделять аналогичным способом ДНК из совсем небольших количеств материала - 20-150 мг. Измельчение производится прямо в эппендорфе спец. пестиком или заплавленным типом на 1000 мкл. Метод работал с лиственничной хвоей - в сухом виде, свежей и замороженной, а также с проростками лиственницы, кукурузы, пшеницы и пр. Единственное - тонкостенные пробирки при экстракции хлороформом разрывало в центрифуге, так что следует подбирать качественные эппендорфы - Treff, Axygen и т.п.
Гость
IP-штамп: frNVjPT6S76SU
гость



 прочитанное сообщение 14.07.2005 14:18     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Метод хороший и мы использовали его много раз .Но бывает примесь РНК.
Участник оффлайн! Fox
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 16.07.2005 20:07     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Метод хороший и если качество устраивает можно значительно сокращать время и количество шагов.
Отлично работает на моллюсках (есть и коммерческий кит) и головастиках с добавлением ProK на стадии перевара. Из свежего материала всегда получается много РНК.
Участник оффлайн! Saveta

Краснодар



 прочитанное сообщение 10.10.2005 11:29     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Метод хороший. Пошел и на грибах. Работали на микрокол-вах.
Пришлось (по материальным причинам) исключить пункт 17 и использовать чистый Хлороформ (насыщенный водой) вместо смеси. А когда пришлось работать без азота, растирала свежий мицелий с буфером - и несмотря на все это - получалось норамально.
Участник оффлайн! Cerevisia




 прочитанное сообщение 12.10.2005 14:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

После инкубации на 65 (30 мин) добавляю равный обьем фенол:хлороформ (1:1), мешать, центрифугировать, снять верхнюю фазу. Добавить равный обьем хлороформа, мешать, центрифугировать, снять верхнюю фазу. Осаждать 0.75 обьемом изопропилового спирта - 10 мин при комнатной температуре. Осадить, осадок промыть этанолом 70%. ДНК годится для ПЦР.
При желании можно почистить РНКазой и повторить фенольно-хлороформную очистку.
Гость
IP-штамп: fre2RSSjxwpqM
гость



 прочитанное сообщение 06.02.2007 18:58     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

У меня токой вопрос. После осаждения ДНК с изопропанолом и центрифугирования, я осадок (ДНК) оставил на ночь в CH3COONa+спирт 76%. Потом отцентрифугировали и добавили воды, но ДНК не растворился. Добавили понемногу больше воды, но полюбому не получилось. Какова может быть причина? (метод Murrey-Thompson)
Участник оффлайн! ада




 прочитанное сообщение 29.06.2007 03:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

привет а у меня вопрос подскажите пожалуйста где искать выделение днк из фитофторы ну очень нужно
Участник оффлайн! Grumeza Radu
Участник
Limburg, Belgium



 прочитанное сообщение 04.07.2007 11:17     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

(Гость @ 06.02.2007 16:58)
Ссылка на исходное сообщение  У меня токой вопрос. После осаждения ДНК с изопропанолом и центрифугирования, я осадок (ДНК) оставил на ночь в CH3COONa+спирт 76%. Потом отцентрифугировали и добавили воды, но ДНК не растворился. Добавили понемногу больше воды, но полюбому не получилось. Какова может быть причина? (метод Murrey-Thompson)

У вас там Polysaccharides завелись (или другие примеси), днка дуба, розы итгд имеют ету неприятную особенность. Растворяется водой (Ph8) 1-3 hours at 65-75 degrees celsius
Гость
IP-штамп: frHWt7eplAB5c
гость



 прочитанное сообщение 06.02.2008 13:39     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Как очистить ДНК,выделенную из проростков пшеницы, с низким показателем чистоты - 1,1405?
Гость
IP-штамп: fr6cFLfn1oQ.A
гость



 прочитанное сообщение 30.08.2008 14:19     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

Скажите а сколько можно хранить растворы с ЦТАБ???
Участник оффлайн! Cerevisia




 прочитанное сообщение 02.09.2008 12:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

(Гость @ 30.08.2008 11:19)
Ссылка на исходное сообщение  Скажите а сколько можно хранить растворы с ЦТАБ???


смотря как хранить и для чего. Для пцр<1000 нк храню в холодильнике при +4 до двух месяцев. Для длинных пцр замораживаю и храню на - 20 до полугода.
Гость
IP-штамп: fr6cFLfn1oQ.A
гость



 прочитанное сообщение 07.10.2008 06:19     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Большое спасибо!!!
Guest
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  07.10.2008 13:00     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

http://www.mrcgene.com/dnazoldirect.htm
Участник оффлайн! Aschenputtel




 прочитанное сообщение 01.03.2009 00:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

Этот метод пригоден не для всех видов растений. Из растнений, которые содержат большое количество полифенольных соединений (или еще какой-то дряни) этим методом выделять невозможно, точнее, выделенная этим методом ДНк требует дополнительной очистки
guest: Николай
IP-штамп: frO1QKyoPizoA
гость



 прочитанное сообщение 12.03.2009 21:18     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

Есть мнение, что в ткани растений подготовленной для выделения ДНК высушиванием, начинают работать ДНК-аза и другие активности. Значит будут потери и искажения результатов. Что ученый народ скажет о таком методе?
Участник оффлайн! mlog
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.03.2009 21:24     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

(guest: Николай @ 12.03.2009 21:18)
Ссылка на исходное сообщение  Есть мнение, что в ткани растений подготовленной для выделения ДНК высушиванием, начинают работать ДНК-аза и другие активности. Значит будут потери и искажения результатов. Что ученый народ скажет о таком методе?

Не замечала никаких отрицательных эффектов, если быстро высушить. Иногда даже специально высушиваю - не люблю из свежего материала ДНК выделять.
Ъ
IP-штамп: frNwv0U1khjS.
гость



 прочитанное сообщение 13.03.2009 10:16     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

(mlog @ 12.03.2009 20:24)
Ссылка на исходное сообщение  Не замечала никаких отрицательных эффектов, если быстро высушить. Иногда даже специально высушиваю - не люблю из свежего материала ДНК выделять.

Специально сушите материал? А выделяете ДНК каким методом из "гербария"? confused.gif
Участник оффлайн! mlog
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.03.2009 16:42     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

(Ъ @ 13.03.2009 09:16)
Ссылка на исходное сообщение  Специально сушите материал? А выделяете ДНК каким методом из  "гербария"? confused.gif

Как-нибудь вот так: http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=141403
или киагеновским/любым аналогичным китом. Именно что из гербария - я же ботаник по образованию, это у меня ещё с курсовой привычка smile.gif
Ъ
IP-штамп: frNwv0U1khjS.
гость



 прочитанное сообщение 13.03.2009 17:42     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

(mlog @ 13.03.2009 15:42)
Ссылка на исходное сообщение  Как-нибудь вот так: http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=141403
или киагеновским/любым аналогичным китом. Именно что из гербария - я же ботаник по образованию, это у меня ещё с курсовой привычка smile.gif

Эта методика не для ленивых - вот что я вам скажу. smile.gif Попробуйте плавно перейти вот на эту методику, которую наша девушка там, в Канаде, опубликовала:
http://www.springerlink.com/content/a46t76...00/fulltext.pdf
Участник оффлайн! mlog
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.03.2009 18:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

(Ъ @ 13.03.2009 17:42)
Ссылка на исходное сообщение  Эта методика не для ленивых - вот что я вам скажу. smile.gif  Попробуйте плавно перейти вот на эту методику, которую наша девушка там, в Канаде, опубликовала:
http://www.springerlink.com/content/a46t76...00/fulltext.pdf

Ой, а не пришлете мне статью? А то тут нет доступа frown.gif
(fagopyrum -at- list.ru)
А один из авторов, Hebert - это баркодер, что ли?
Ъ
IP-штамп: frNwv0U1khjS.
гость



 прочитанное сообщение 13.03.2009 18:39     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

(mlog @ 13.03.2009 17:33)
Ссылка на исходное сообщение  Ой, а не пришлете мне статью? А то тут нет доступа frown.gif
(fagopyrum -at- list.ru)
А один из авторов, Hebert - это баркодер, что ли?

Кто такой Hebert, спросите у Наташи.
Мария, Вам придется мыло выставлять для фултекста.
Участник оффлайн! mlog
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.03.2009 18:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #23 множественное цитирование

Так я же написала - fagopyrum@list.ru
просто @ на -at- заменила, как это обычно делают.
Ъ
IP-штамп: frNwv0U1khjS.
гость



 прочитанное сообщение 13.03.2009 18:51     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #24 множественное цитирование

(mlog @ 13.03.2009 17:33)
Ссылка на исходное сообщение  Ой, а не пришлете мне статью? А то тут нет доступа frown.gif
(fagopyrum -at- list.ru)
А один из авторов, Hebert - это баркодер, что ли?

Отправил.
guest: Ник
IP-штамп: frYsvdPA2O.aE
гость



 прочитанное сообщение 01.12.2014 02:36     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #25 множественное цитирование

Из живых веток получится?

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 16.11.18 09:20
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft